Slujitorii Domnului au inceput chiar sa demoleze, fara nicio instiintare prealabila, unul dintre spatiile apartinand bazei de cercetare arheologica. In anul 2000, dupa parcurgerea tuturor procedurilor de judecata, instanta s-a pronuntat in favoarea bisericii. Astfel, Manastirea Turnu a obtinut 12,7 hectare dintr-o suprafata totala de aproximativ 17 hectare si a reinfiintat o biserica ridicata in anul 1672 de Antonie Voda.
Celelalte patru hectare de teren au ramas in administrarea Muzeului Judetean de Istorie si Arheologie . Pe terenul retrocedat au ramas insa si ruinele unui important castru roman si ale unor reprezentative monumente medievale.
Pana in prezent, arheologii au putut intra pe terenul manastirii pentru a continua cercetarile, existand acordul comun pentru parafarea unui protocol oficial de colaborare.